ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างชิราลที่มีการป้องกันสำหรับการสร้างเปปไทด์เชิงซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบ สเตอรีโอเคมีของมันช่วยให้สามารถควบคุมได้อย่างแม่นยำในการสร้างลำดับเปปไทด์เฉพาะ โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์แบบเฟสแข็ง หมู่ Fmoc ช่วยให้เกิดการป้องกัน N-terminal ที่ย้อนกลับได้ รองรับการถอดป้องกันด้วยเบสอ่อน ทำให้เหมาะสำหรับการยืดขั้นตอนทีละขั้นในเครื่องสังเคราะห์อัตโนมัติ หมู่ Boc บนอะมีนทุติยภูมิให้การป้องกันแบบออร์โธกอนัล ช่วยให้สามารถถอดป้องกันแบบเลือกเพศได้ในกระบวนการหลายขั้นตอน นิยมใช้ในการเตรียมสารกลางเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ที่ความสมบูรณ์ของสเตอรีโอเคมีมีความสำคัญ ประโยชน์ของมันในเคมีคอมบิเนตอเรียลและการค้นพบยาทำให้เป็นสารเคมีที่มีค่ามากในงานวิจัยเคมียารักษา