ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเปปไทด์หรือสารยับยั้งเอนไซม์ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างโครงสร้างของกรดอะมิโนที่มีความเฉพาะตัวสูง โดยเฉพาะในยาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น ยาต้านไวรัสหรือยาสำหรับรักษามะเร็ง โครงสร้างไซโคลโพรพิลและหมู่ป้องกัน tert-butoxycarbonyl (Boc) ช่วยเพิ่มความเสถียรและควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำในสภาวะสังเคราะห์สารเชิงซ้อน