ใช้เป็นตัวสร้างโครงสร้างแบบคิรัล (chiral building block) ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบกลาง (centrally acting agents) เนื่องจากมีความคล้ายคลึงทางโครงสร้างกับอนุพันธ์ไซโคลเฮกเซนที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ (bioactive cyclohexane derivatives) โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียาในการปรับปรุงยาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท (neurological disorders) นิยมใช้ในการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริก (asymmetric synthesis) เพื่อนำการควบคุมสเตอรีโอเคมีคอล (stereochemical control) เข้าสู่ส่วนประกอบยาสำคัญที่ออกฤทธิ์ (active pharmaceutical ingredients: APIs)