ใช้ในกระบวนการพัฒนายาที่มีเป้าหมายในการยับยั้งเอนไซม์เฉพาะ โดยเฉพาะในกลุ่มโปรตีเอส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการแพร่กระจายของไวรัส เช่น ไวรัสตับอักเสบซี หรือไวรัสบางชนิดที่ต้องใช้เอนไซม์นี้ในการจำลองตัว มีโครงสร้างที่ออกแบบมาเพื่อจับกับตำแหน่งการทำงานของเอนไซม์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้ช่วยลดการแพร่เชื้อ นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์ยารุ่นใหม่ที่ต้องการความจำเพาะสูงและผลข้างเคียงต่ำ