สารนี้เป็น (R)-4-(((9H-ฟลูออเรน-9-อิล)เมทอกซี)คาร์บอนิล)พิเพอราซีน-2-คาร์บอกซิลิกแอซิด ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างที่มีคีรอลสำหรับการเตรียมยาที่มีโครงสร้างซับซ้อน การประยุกต์ใช้หลักอยู่ที่การป้องกันหมู่อะมีนในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่บริสุทธิ์แบบเอนานติโอเมอร์ หมู่ฟลูออเรนิลเมทิลออกซิคาร์บอนิล (Fmoc) ช่วยให้เกิดกลยุทธ์การป้องกันแบบออร์โธกอนอลในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (solid-phase peptide synthesis) ซึ่งสามารถกำจัดเลือกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อนโดยไม่กระทบต่อหมู่ฟังก์ชันที่ละเอียดอ่อนอื่นๆ แหวนพิเพอราซีนที่มีหมู่คาร์บอกซิลช่วยเป็นจุดจับสำหรับปฏิกิริยาการจับคู่ต่อไป ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบเปปไทด์มิมิติกและโมเลกุลชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งโปรติเอสและลิแกนด์รีเซพเตอร์ที่สเตอรีโอเคมีมีบทบาทสำคัญต่อกิจกรรมชีวภาพ