ใช้ในงานสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างสารตั้งต้นสำหรับการผลิตยาหรือสารชีวภาพที่มีความเฉพาะตัวสูง เนื่องจากมีหมู่ไซคลิกและโครงสร้างที่มีศูนย์อสมมาตร ทำให้เหมาะสำหรับการควบคุมการเกิดปฏิกิริยาแบบเลือกจำเพาะทางอวกาศ (stereoselective reaction) เช่น ในปฏิกิริยา Diels-Alder และการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยา (reagent) หรือตัวดักจับสารในงานวิจัยด้านชีวเคมี โดยเฉพาะในการปรับเปลี่ยนโปรตีนหรือเปปไทด์ที่มีหมู่ฟังก์ชันเฉพาะ เช่น หมู่ไซซีน (cysteine) เนื่องจากหมู่มาเลไมด์สามารถทำปฏิกิริยากับหมู่ -SH ได้อย่างมีประสิทธิภาพ จึงนิยมใช้ในงานพัฒนายาแบบเป้าหมาย (targeted drug) หรือการติดฉลากโมเลกุลในงานวินิจฉัย รวมถึงการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพและโพลิเมอร์ที่มีคุณสมบัติทางแสง