ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างไดเปปไทด์ที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์ที่ซับซ้อนแบบขั้นตอนด้วยการควบคุมสเตอริโอเคมีสูง กลุ่ม Fmoc ช่วยในการป้องกันอะมีนแบบละลายในเบสอ่อน ซึ่งเข้ากันได้กับการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็ง ในขณะที่กรดคาร์บอกซิลิกสามารถถูกกระตุ้นสำหรับการสร้างพันธะอะไมด์ โครงสร้างข้างโซ่แอลกิลแบบกิ่งช่วยปรับความสามารถในการละลายของเปปไทด์และความเสถียรเชิงโครงสร้าง นิยมใช้ในการเตรียมเปปไทด์ที่มีโครงสร้าง แหล่งย่อยสลายของเอนไซม์ และเพปไทโดมิมเมติกสำหรับการวิจัยเภสัชกรรม