ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ การประยุกต์ใช้หลักอยู่ในปฏิกิริยาคัปปลิงข้ามซูซูกิ-มิยะอุระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) ซึ่งกลุ่มบอโรเนตเอสเตอร์ช่วยให้เกิดการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการผลิตอนุพันธ์กรดอะมิโนแบบคีรัลและเปปไทโดมิมิติกส์ (peptidomimetics) การมีกลุ่มอะมีนที่ป้องกันด้วย Boc และฟังก์ชันเอสเตอร์ช่วยให้สามารถคัดลอกการป้องกันและการปรับแต่งเพิ่มเติมได้อย่างเลือกสรร สนับสนุนการใช้ในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอนของยารักษา นิยมใช้ในการวิจัยและพัฒนายับยั้งโปรติเอส (protease inhibitors) อะโกนิสต์ตัวรับ (receptor agonists) และตัวแทนบำบัดอื่นๆ ที่ต้องการความบริสุทธิ์ของเอนแอนติโอเมอร์สูง