สารนี้ใช้เป็นตัวตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรม เนื่องจากมีหมู่ Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ซึ่งทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยให้สามารถควบคุมการสร้างพันธะเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำในขั้นตอน solid-phase peptide synthesis (SPPS) โครงสร้างไซคลิคของพิเพอริโดนและไพรโรลิดีนช่วยเพิ่มความเสถียรและอาจมีผลต่อการจำลองโครงสร้างสามมิติของเปปไทด์หรือสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ จึงนิยมใช้ในงานพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะสูง เช่น สารยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์สำหรับตัวรับเฉพาะ