ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะบล็อกสร้างกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนซึ่งต้องการการควบคุมสเตอริโอเคมี หมู่ฟลูออเรนิลเมท็อกซี่คาร์บอนิล (Fmoc) ช่วยในการป้องกันหมู่อะมีนอย่างย้อนกลับได้ อนุญาตให้ประกอบแบบขั้นตอนในสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง ส่วนของ difluorocyclobutyl นำเสนอความแข็งตัวทางโครงสร้างคอนฟอร์เมชันและเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ทำให้สารประกอบนี้มีคุณค่าต่อเคมีเภสัชกรรมในการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพที่มีคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น ใช้กันทั่วไปในสถานที่วิจัยสำหรับสังเคราะห์ตัวยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์ตัวรับ ซึ่งการ fluorination ช่วยปรับความสัมพันธ์การจับและ lipophilicity