trans-Sulfo-SMCC ถูกใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาประสาน (crosslinking agent) ที่สำคัญในงานชีววิทยาโมเลกุลและโปรตีนวิศวกรรม โดยมันสามารถจับระหว่างโปรตีนหรือเปปไทด์ที่มีหมู่อะมิโน (เช่น กลุ่ม -NH₂ จากเหลือซีน) กับสารประกอบที่มีหมู่ซัลฟ์ไฮดริล (เช่น -SH จากซิสเทอีน) ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เหมาะสำหรับการเชื่อมต่อแอนติบอดีกับเอนไซม์ ฟลูออเรสเซนต์แท็ก หรือโปรตีนนำส่งยาในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ trans-Sulfo-SMCC ยังนิยมใช้ในการเตรียมแอนติบอดี-ยารวม (antibody-drug conjugates: ADCs) เนื่องจากมีความเสถียรและสามารถควบคุมการจับตัวได้ดีในสภาวะน้ำ โดยหมู่ซัลโฟซัคซิมิไดด์ของมันทำให้ละลายน้ำได้ดีและลดการรวมตัวกันของโปรตีนในระหว่างกระบวนการ ในงานวิจัย trans-Sulfo-SMCC ยังถูกใช้ในการสร้างไมโครอาเรย์ หรือผิววัสดุที่ปรับเปลี่ยนพื้นผิวเพื่อจับโมเลกุลชีวภาพเฉพาะเจาะจง ซึ่งมีประโยชน์ในระบบตรวจวัดทางชีวภาพ เช่น เซนเซอร์ตรวจจับโปรตีนหรือดีเอ็นเอ