สารนี้ใช้เป็นตัวตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรม ซึ่งช่วยในการป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (Solid-phase peptide synthesis) โครงสร้างที่มีหมู่ Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำให้สามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน โดยไม่ทำลายพันธะเปปไทด์หรือหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ ที่ไวต่อกรด ส่งผลให้เหมาะสำหรับการสร้างเปปไทด์ซับซ้อนที่ต้องการความบริสุทธิ์สูง และใช้บ่อยในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อพัฒนายาหรือโปรตีนจำลอง