ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างที่มีคีรอลสำหรับการเตรียมเปปไทด์ที่ซับซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบ กลุ่มฟลูออเรนิลเมทิลออกซิคาร์บอนิล (Fmoc) ช่วยให้การป้องกัน N-terminal ได้อย่างย้อนกลับ ซึ่งอนุญาตให้ประกอบโซ่เปปไทด์แบบขั้นตอนภายใต้สภาวะเบสอ่อน กลุ่มข้างที่มีนาฟทิลให้ความใหญ่เชิง steric และลักษณะ hydrophobic ทำให้มีคุณค่าต่อการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมในเปปไทด์สังเคราะห์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (SPPS) ซึ่ง stereochemistry ของมันสนับสนุนการก่อตัวของโครงสร้างรองเฉพาะ นอกจากนี้ ยังพบการประยุกต์ใช้ในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ active รวมถึงตัวยับยั้งเอนไซม์และลิแกนด์ตัวรับ ในงานวิจัยเภสัชกรรม