SU5408 เป็นสารยับยั้งการทำงานของตัวรับที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของหลอดเลือด (VEGFR) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการยับยั้งการสร้างหลอดเลือดใหม่ (anti-angiogenesis) ทำให้สารนี้ถูกใช้ในการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับโรคมะเร็ง เนื่องจากมะเร็งต้องการหลอดเลือดใหม่เพื่อเลี้ยงเซลล์ที่เติบโตอย่างรวดเร็ว การยับยั้งกระบวนการนี้จึงช่วยชะลอการเติบโตและการแพร่กระจายของเนื้องอกได้ ในงานวิจัย SU5408 มักใช้เป็นเครื่องมือทางชีววิทยาเพื่อศึกษาเส้นทางสัญญาณของโปรตีนคินาส โดยเฉพาะในระบบเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการอยู่รอดของเซลล์ การใช้สารนี้ช่วยให้นักวิจัยเข้าใจบทบาทของ VEGFR และเป้าหมายอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาของโรคต่าง ๆ ได้ดีขึ้น อย่างไรก็ตาม SU5408 ยังไม่ถูกพัฒนาให้เป็นยาสำหรับใช้รักษาผู้ป่วยโดยทั่วไป เนื่องจากมีข้อจำกัดด้านความเสถียรและประสิทธิภาพในร่างกาย จึงถูกใช้เฉพาะในห้องปฏิบัติการเพื่อการศึกษาเท่านั้น