ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเป็นพิโรลิดีน ซึ่งมักพบในยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการชัก ยาปรับสภาพจิต หรือยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังนิยมใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารตั้งต้นที่มีความเฉพาะตัวสูง โดยเฉพาะในระบบ asymmetric synthesis เนื่องจากหมู่ Boc ช่วยป้องกันการเกิดปฏิกิริยาของหมู่อะมิโนได้อย่างมีประสิทธิภาพ และสามารถกำจัดออกได้ง่ายภายหลังเมื่อต้องการเปิดหมู่อะมิโนเพื่อทำปฏิกิริยาต่อไป