ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือบิวลดิงบล็อก (building block) สำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างเฉพาะ โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาที่ต้องการความบริสุทธิ์และเลือกจำเพาะต่อไอโซเมอร์ (เช่น สารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพที่ต้องการรูปแบบสเตอริโอไอโซเมอร์แบบ S) เนื่องจากมีหมู่ป้องกัน tert-butoxycarbonyl (Boc) จึงช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งได้ดี และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว (stepwise synthesis) ในระบบเปปไทด์ และยังใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีเพื่อศึกษาการทำงานของเอนไซม์หรือการจำลองโครงสร้างของโปรตีน