ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์และเคมียา สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยแบบ chiral สำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับโมเลกุลที่ต้องการการควบคุม stereochemistry โครงสร้างของมันประกอบด้วยหมู่ฟังก์ชันที่ได้รับการป้องกันสองกลุ่ม—Fmoc และ Boc—ซึ่งช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกเพศและการประกอบแบบ stepwise ของเปปไทด์หรือ peptidomimetics หมู่ Fmoc ช่วยให้การสังเคราะห์เปปไทด์แบบ solid-phase โดยให้การป้องกัน N-terminal ที่ย้อนกลับได้ ซึ่งสามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน ในขณะที่หมู่ Boc ให้ความเสถียรภายใต้สภาวะเหล่านี้และสามารถตัดออกภายหลังภายใต้สภาวะกรด กลยุทธ์การป้องกันแบบคู่นี้ทำให้สารประกอบมีคุณค่าต่อการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพและยาโมเลกุลเล็กที่กำหนดเป้าหมายไปยังโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคเมแทบอลิซึม โครงสร้าง backbone แบบ piperazine ยังช่วยเพิ่มความละลายและ bioavailability ในตัวยารับสมัคร ทำให้มีประโยชน์ในการปรับปรุง lead ระหว่างการค้นพบยา