ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างกรดอะมิโนแบบ chiral ที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพในการนำหมู่ trifluoromethyl-modified เข้าสู่โซ่เปปไทด์ กลุ่ม Fmoc ช่วยให้เกิดการป้องกันแบบ base-labile ที่อ่อนโยน สอดคล้องกับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (SPPS) ซึ่งช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์ที่ซับซ้อนแบบทีละขั้นตอนได้ ความจำเพาะทาง stereochemistry ช่วยควบคุม chirality ซึ่งมีความสำคัญต่อกิจกรรมทางชีวภาพในงานเภสัชกรรม กลุ่ม trifluoromethyl ที่มีลักษณะ electron-withdrawing ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ lipophilicity ของเปปไทด์ที่ได้ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนา peptidomimetics และโมเลกุลชีวภาพที่มีโปรไฟล์เภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์รีเซพเตอร์ โดยที่ fluorination ช่วยปรับ binding affinity และความต้านทานต่อการย่อยสลาย