ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (Solid-phase peptide synthesis) โดยทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยของกรดอะมิโนที่มีหมู่ป้องกัน (protected amino acid building block) ซึ่งหมู่ Fmoc (9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonyl) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ ช่วยให้สามารถสร้างพันธะเปปไทด์ได้อย่างมีลำดับและแม่นยำ โดยหลังจากที่เติมกรดอะมิโนตัวถัดไปแล้ว สามารถกำจัดหมู่ Fmoc ออกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน เช่น ใช้เพอิโตรลีน (piperidine) ทำให้กระบวนการสังเคราะห์ดำเนินต่อไปได้ เหมาะสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและเภสัชกรรม