สารนี้ใช้เป็นตัวตั้งต้น (intermediate) ในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างเป็นเพพไทด์หรือสารที่มีไนโตรเจนเป็นองค์ประกอบสำคัญ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่ต้องการความเฉพาะตัวของโครงสร้างแบบสเตอริโอ (stereoselective synthesis) เนื่องจากมีหมู่ Cbz (benzyloxycarbonyl) ที่ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการได้ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างโครงสร้างของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านไวรัส ยากดภูมิคุ้มกัน หรือสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โดยโครงสร้างเพอริไดน์ที่มีหมู่ tert-butyloxycarbonyl (Boc) และ Cbz ช่วยให้สามารถควบคุมลำดับการสร้างพันธะเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ภายหลังโดยไม่ทำลายโครงสร้างหลัก