ใช้เป็นสารกลางเคมี chiral สำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและยาต้านไวรัส โครงสร้างพิเพอริดีนฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในยาตัวสมัคร ใช้อย่างแพร่หลายในการเตรียมส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับการรักษาโรคตับอักเสบซีและโรคไวรัสอื่นๆ การมีทั้งหมู่อะมีนและฟลูออรีนช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าสำคัญในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR)