ใช้ซูเปอร์ซินนามัลดีไฮด์เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและน้ำหอม เนื่องจากมีโครงสร้างที่คล้ายซินนามัลดีไฮด์แต่มีคุณสมบัติทางเคมีที่ดีกว่า ทำให้สามารถใช้ในปฏิกิริยาคอนดิเนชันได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น การสร้างพันธะคู่คาร์บอน-คาร์บอนในโมเลกุลขนาดใหญ่ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนายาต้านจุลชีพและยาต้านอักเสบ เนื่องจากแสดงฤทธิ์ยับยั้งการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์บางชนิดในระดับเซลล์ รวมถึงมีการศึกษาใช้ในผลิตภัณฑ์เครื่องสำอางเพื่อควบคุมการผลิตเมลานิน ช่วยลดการเกิดฝ้าและจุดด่างดำบนผิวหนัง