ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารป้องกันเชื้อรา หมู่ทริฟลูโอมีธิลช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในการปรับปรุงกิจกรรมทางชีวภาพของสารออกฤทธิ์หลัก นิยมใช้ในปฏิกิริยาคัปปลิ้งแบบมีซัลเฟอร์เพื่อนำหมู่เบนโซไทโอเอทที่ถูกฟังก์ชันนัไลซ์เข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบสารประกอบใหม่ที่มีความคงทนต่อสิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้นและความจำเพาะต่อเป้าหมายในเคมีป้องกันพืช