ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบเปปไทด์และสารชีวโมเลกุลที่มีโครงสร้างเฉพาะ โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้น (building block) ในการสร้างเปปไทด์ที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยาที่ต้องการควบคุมรูปร่างของโมเลกุลผ่านศูนย์ไม่สมมาตร นิยมใช้ในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบแข็ง (solid-phase synthesis) เนื่องจากหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยป้องกันไม่ให้หมู่อะมิโนทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน หมู่อัลไคน์ (alkyne) ที่ปลายสายโซ่สามารถใช้ต่อพันธะกับโมเลกุลอื่นผ่านปฏิกิริยา click chemistry เช่น Huisgen cycloaddition เพื่อสร้างโครงสร้างที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิภาพ จึงนิยมใช้ในงานพัฒนายาแบบ targeted therapy และโมเลกุลนำส่งยา (drug delivery systems)