ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะสำหรับการนำโครงสร้างคล้ายไทโรซีนที่มีความละลายในน้ำเพิ่มขึ้น หมู่ซัลโฟเนตช่วยเพิ่มความละลายในน้ำ ทำให้มีคุณค่าการคูเปิลเปปไทด์ในเฟสละลายที่ต้องการอินเตอร์มีเดียตที่มีขั้ว โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการสังเคราะห์เฟสแข็งเมื่อทำงานกับกลยุทธ์ Fmoc ซึ่งอนุญาตให้มีสภาวะเดปโพรเทคชันอ่อนโยนในขณะที่รักษาการป้องกันข้างโซ่ คุณสมบัติเรืองแสงที่สืบทอดมาจากหมู่ฟลูออเรนิลช่วยให้ตรวจจับได้ระหว่างขั้นตอนโครมาโทกราฟีหรือการทำให้บริสุทธิ์ ใช้บ่อยในการเตรียมเปปไทด์ชีวกิจกรรม มิเมติกโปรตีน และเปปไทด์ที่ติดฉลากสำหรับการทดสอบทางชีวเคมี