สารนี้ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพและตัวกลางเภสัชกรรม หมู่ Fmoc (9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonyl) ช่วยในการสังเคราะห์แบบเฟสแข็งโดยให้การป้องกัน N-terminal ชั่วคราวที่สามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน หมู่ methoxypyridine สามารถทำหน้าที่เป็นลิแกนด์หรือส่วนประกอบโครงสร้างในการออกแบบยา โดยเฉพาะในตัวยับยั้ง kinase หรือตัวปรับตัวรับ จุด chiral ของมันช่วยให้เกิดการรวมตัวแบบ stereoselective เข้าสู่โมเลกุลเป้าหมาย ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่บริสุทธิ์แบบ enantiomer ทั่วไปใช้ในสถานที่วิจัยสำหรับสังเคราะห์ยาที่มีฐานเปปไทด์ซึ่งมีเสถียรภาพและความสัมพันธ์ในการจับที่เพิ่มขึ้น