ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง (Solid-phase peptide synthesis) เป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโนของกรดอะมิโน ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดพันธะเปปไทด์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยเฉพาะในกรณีที่ต้องการสร้างเปปไทด์ที่มีลำดับเฉพาะและลดการเกิดปฏิกิริยาข้างเคียง หมู่ Fmoc (9H-Fluoren-9-ylmethoxycarbonyl) สามารถถอดออกได้ง่ายด้วยสารละลายเบสอ่อน เช่น ไพริโอดีน ทำให้เหมาะกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว และสามารถใช้ร่วมกับหมู่ป้องกันอื่นๆ ที่ตอบสนองต่อสภาวะกรดได้ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุล ยาชีวภาพ และโปรตีนสังเคราะห์