สารนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะสำหรับการนำกรดอะมิโนที่มี piperazine เข้าสู่โซ่เปปไทด์ กลุ่ม Fmoc ช่วยให้การป้องกันที่ละลายได้ด้วยเบสอ่อน ซึ่งสอดคล้องกับการสังเคราะห์แบบเฟสแข็ง ทำให้เหมาะสำหรับการประกอบเปปไทด์อัตโนมัติ กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) บนไนโตรเจนของ piperazine ให้การป้องกันแบบ orthogonal ซึ่งช่วยให้การถอดป้องกันแบบเลือกเพศการปรับแต่งเพิ่มเติมในกระบวนการหลายขั้นตอน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการเตรียมเปปไทด์ซับซ้อนและ peptidomimetics ที่ใช้ในการวิจัยเภสัชภัณฑ์ รวมถึงยาตัวสมัครสำหรับโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคเมแทบอลิซึม คุณสมบัติโครงสร้างช่วยปรับปรุงความละลายและการควบคุมโครงสร้างเชิง conformational ส่งเสริมการออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรมสูง