สารนี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นบล็อกสร้างกรดอะมิโนแบบ chiral ที่ได้รับการป้องกัน การประยุกต์ใช้หลักคือในการเตรียมเปปไทด์ที่ถูกดัดแปลงเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการควบคุมโครงสร้างเชิงคอนฟอร์เมชัน โซ่ข้างที่ difluorinated มีอิทธิพลต่อเรขาคณิตของโครงสร้าง backbone เปปไทด์และช่วยปรับปรุง bioavailability ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ กลุ่ม Fmoc ช่วยให้การป้องกันแบบอ่อนโยนและละลายได้ด้วยเบสในระหว่างการสังเคราะห์แบบ solid-phase ซึ่งช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์ที่ซับซ้อนแบบทีละขั้นตอน มีประโยชน์อย่างยิ่งในงานวิจัยที่มุ่งเน้นการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) ของเปปไทด์ชีวภาพ