ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนและเปปไทด์เลียนแบบ (peptidomimetics) หมู่ 2-ไซยาโนฟีนิลให้คุณสมบัติทาง steric และ electronic ที่มีอิทธิพลต่อการกำหนดรูปร่างในการเชื่อมต่อ (coupling steps) หมู่ Fmoc ช่วยป้องกันหมู่อะมีนแบบอ่อนโยนและละลายด้วยเบส ทำให้เข้ากันได้กับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง (solid-phase synthesis) ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายาและโมเลกุลชีวภาพที่ stereochemistry และความสามารถของสายข้างมีความสำคัญ การกำหนดค่าทางชิรัล (S) รับประกันการรวมตัวแบบ enantioselective เข้าสู่โซ่เปปไทด์ รักษากิจกรรมทางชีวภาพที่ต้องการ