ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาหรือสารชีวภาพที่ต้องการโครงสร้างโมเลกุลแบบเฉพาะตัว ด้วยคุณสมบัติของหมู่ไอโซไซยาเนตที่มีปฏิกิริยาได้ง่ายกับสารประกอบที่มีหมู่ -OH หรือ -NH2 ทำให้สามารถสร้างยูเรีย หรือคาร์บามีนได้ จึงเหมาะสำหรับการสร้างสารตัวกลางในห้องปฏิบัติการวิจัยด้านเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชชนิดใหม่ที่มีความจำเพาะสูงและย่อยสลายได้ง่ายในสิ่งแวดล้อม