ใช้หลักๆ เป็นสารตัวเชื่อมสองหน้าที่ (bifunctional coupling agent) ในการสังเคราะห์อินทรีย์และวิทยาศาสตร์วัสดุ กลุ่มบอโรเนตเอสเตอร์ช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาครอสคัปเปลิงแบบซูซูกิ-มิยะอุระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร

กลุ่มซิลิลเอเทอร์ให้ความเสถียรและสามารถกำจัดออกได้อย่างเลือกสรรภายใต้สภาวะกรดอ่อนหรือการกระตุ้นด้วยฟลูออไรด์ ทำให้มีประโยชน์ในการป้องกันกลุ่มแอลกอฮอล์ระหว่างการสังเคราะห์หลายขั้นตอน

นิยมใช้ในการเตรียมโมเลกุลซับซ้อนที่ต้องการกลยุทธ์ป้องกันแบบออร์โธกอนัล (orthogonal protection strategies)

นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการปรับเปลี่ยนพื้นผิวของซิลิกาและวัสดุฐานซิลิกอน โดยกลุ่มซิเลนยึดโมเลกุลกับพื้นผิว ในขณะที่ส่วนบอโรเนตให้จุดยึดสำหรับการฟังก์ชันนัไลเซชันเพิ่มเติมผ่านครอสคัปเปลิง

มีประโยชน์ในการพัฒนาเซ็นเซอร์ พอลิเมอร์ที่ถูกฟังก์ชันนัไลซ์ และไบโอคอนจูเกต