ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในระบบ Fmoc solid-phase synthesis ซึ่งสารนี้เป็นอนุพันธ์ของ L-ทริปโตเฟนที่ได้รับการป้องกันด้วย Fmoc ที่หมู่อะมิโนอัลฟา Boc (tert-butyl carboxylate) ที่ไนโตรเจนของอินโดล และกรดคาร์บอกซิลิกที่ถูกกระตุ้นเป็นเอสเตอร์เพอร์ฟลูออโรเฟนิล หมู่ Fmoc ช่วยให้ถอดป้องกันได้อย่างอ่อนโยนภายใต้สภาวะเบส ทำให้เข้ากันได้กับการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็ง หมู่ tert-butyl และอินโดลให้การป้องกันแบบ steric และความหลากหลายทางโครงสร้าง มีประโยชน์ในการพัฒนายาขัดต่อโปรติเอสหรือโปรตีนรับ หมู่เพอร์ฟลูออโรเฟนอกซีทำหน้าที่เป็นเอสเตอร์กระตุ้น ช่วยให้การสร้างพันธะอะไมด์มีประสิทธิภาพโดยเป็น leaving group ที่ดีและเพิ่มความละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมที่ต้องการเปปไทด์หรือโปรตีนสังเคราะห์ที่มีความบริสุทธิ์สูง เช่น สารยับยั้งเอนไซม์และเปปไทโดมิมเมติกส์