ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารที่ติดฉลากด้วยรังสีสำหรับการถ่ายภาพทางการแพทย์ หมู่ไอโอดีนช่วยให้สามารถนำไอโซโทปกัมมันตภาพรังสี เช่น ไอโอดีน-123 หรือ ไอโอดีน-131 มาใช้ได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างตัวติดตามสำหรับคอมพิวเตอร์โทโมกราฟีการปล่อยโฟตอนเดี่ยว (SPECT) หมู่แอมีนที่ได้รับการป้องกันช่วยอำนวยความสะดวกในการเกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่มุ่งเป้าไปยังระบบประสาทและระบบต่อมไร้ท่อ นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษสำหรับการวิจัยด้านการจับกับตัวรับและเส้นทางเมแทบอลิซึม