ใช้ในอุตสาหกรรมยาเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะยาต้านการอักเสบ ยาแก้ปวดชนิดไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) ยาต้านมะเร็ง และสารที่ออกฤทธิ์ต่อตัวรับฮอร์โมนบางชนิด ซึ่งหมู่ไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในไขมัน เสถียรภาพของโมเลกุล ความคงตัวทางเมแทบอลิซึม และลิโพฟิลิก ส่งผลให้ยาออกฤทธิ์ได้ดีขึ้น คงอยู่ในร่างกายได้นานขึ้น มี bioavailability และ binding affinity ที่ดีขึ้น โดยโครงสร้างของมันสามารถปรับแต่งได้ง่ายเพื่อให้ได้สารอนุพันธ์ที่มีความจำเพาะและมีฤทธิ์สูง นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากคุณสมบัติดึงอิเล็กตรอนของหมู่ไตรฟลูออร์เมทิลที่ช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ