ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่น ๆ โดยเฉพาะในงานผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากหมู่ไตรฟลูออร์เมทอกซีมีผลช่วยเพิ่มความสามารถในการซึมผ่านของสารเข้าสู่เซลล์เป้าหมาย และเพิ่มความคงตัวของโมเลกุลในสภาวะต่าง ๆ นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ ที่ต้องการโครงสร้างอารมาติกที่มีหมู่ฟลูออรีนเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติด้านเภสัชจลนศาสตร์