ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฟลูออรีนซึ่งต้องการความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการย่อยสึกที่เพิ่มขึ้น โครงสร้างอโรมาติกที่มีฟลูออรีนสามตำแหน่งทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อปรับคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ของสารออกฤทธิ์ ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งโปรติเอสและตัวยับยั้งคินาส นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในการวิจัยด้านเกษตรเคมีเพื่อออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและโปรไฟล์ด้านสิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น อะตอมฟลูออรีนของสารช่วยอำนวยการจับเฉพาะเจาะจงในระบบชีวภาพ ทำให้มีประโยชน์ในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-ฤทธิ์ (SAR)