ใช้ในสังเคราะห์สารคาร์โบไฮเดรตที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างไกลโคไซด์และโอลิโกแซ็กคาไรด์ เนื่องจากหมู่เบนซิลช่วยป้องกันตำแหน่งไฮดรอกซิลไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนที่ไม่ต้องการ ทำให้สามารถควบคุมการสังเคราะห์ได้อย่างแม่นยำ โดยหลังจากนั้นสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ด้วยวิธีดีเบนซิลเลชัน เช่น การทำปฏิกิริยารีดักชันด้วยไฮโดรเจนในสภาวะที่มีตัวเร่งปฏิกิริยาโลหะ จึงนิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมที่ต้องการสารตั้งต้นที่มีความบริสุทธิ์และโครงสร้างเฉพาะ