ใช้เป็นตัวกลางสำคัญ (key intermediate) ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาปฏิชีวนะ หมู่คลอไรด์ที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้สามารถเชื่อมต่อกับโมเลกุลอื่นได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาที่มีฐานเป็นไทอะซอลและสารเคมีเกษตร เนื่องจากความสามารถในการเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับมัด (binding affinity) นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำหมู่ไทอะซอล-2-คาร์บอนิลเข้าไปในโมเลกุลที่ใหญ่กว่าสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (structure-activity relationship studies)