ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีละเอียด โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างไซโคลเฮกซิลที่แข็งและมีสเตอรีโอเคมีที่กำหนดทำให้มีคุณค่าในการออกแบบยาเพื่อปรับการคอนฟอร์เมชันของโมเลกุลและปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ใช้โดยทั่วไปในการเตรียมอนุพันธ์อะไมด์และยูเรียสำหรับใช้ในการวิจัยเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในสารเคมีเกษตรเพื่อพัฒนาส่วนผสมออกฤทธิ์ที่มีโครงสร้างที่ปรับปรุงแล้ว รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลายและการจัดการในระบบปฏิกิริยาน้ำ