ใช้เป็นสารตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของสารนี้ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้น ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างเพปไทโดมิมเมติกส์และตัวยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับการศึกษาการจับกับตัวรับ เนื่องจากโครงสร้าง backbone ไซโคลเฮกซิลที่แข็งและความหลากหลายของกลุ่มฟังก์ชัน