ใช้ในอุตสาหกรรมยาเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านภาวะซึมเศร้าและยากระตุ้นประสาท โครงสร้างไซโคลโพรพิลามีนช่วยเพิ่มเสถียรภาพของโมเลกุลและช่วยให้สารออกฤทธิ์ได้ดีขึ้นในร่างกาย นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเพื่อพัฒนายาใหม่ที่ต้องการความจำเพาะสูงต่อตัวรับในสมอง