ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกลุ่มสารที่มีฤทธิ์ยับยั้งเอนไซม์หรือมีกิจกรรมต่อระบบประสาทส่วนกลาง พบว่าสารอนุพันธ์ของไอโซควิโนลีนที่มีโครงสร้างคล้ายกันมักถูกพัฒนาเพื่อใช้ในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์ หรือภาวะซึมเศร้า สารนี้อาจทำหน้าที่เป็นตัวกลางในการพัฒนายาที่มีเป้าหมายเฉพาะเจาะจงต่อตัวรับหรือช่องไอออนในเซลล์ประสาท นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการศึกษาเชิงโครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงของยาในกลุ่มนี้