ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างของกรดไขมันไม่อิ่มตัว ซึ่งมีพันธะคู่ในตำแหน่งที่เฉพาะเจาะจง นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาโมเลกุลเป้าหมายที่เกี่ยวข้องกับการส่งสัญญาณในเซลล์ นอกจากนี้ยังสามารถใช้เป็นรีเอเจนต์ในการเติมหมู่ฟังก์ชันอื่นผ่านปฏิกิริยาแทนที่นิวคลีโอไฟล์ เนื่องจากหมู่เมทิลซัลโฟเนตทำหน้าที่เป็นหมู่ที่หลุดได้ดี