Cinaciguat ใช้หลักในการรักษาภาวะหัวใจล้มเหลวรุนแรงเฉียบพลัน (ADHF) และภาวะความดันโลหิตสูงในหลอดเลือดปอด (PAH) โดยมีกลไกการออกฤทธิ์ผ่านการกระตุ้นเอนไซม์ soluble guanylate cyclase (sGC) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการหดตัวของหลอดเลือดและความดันโลหิต การเพิ่มกิจกรรมของ sGC ช่วยส่งเสริมการขยายตัวของหลอดเลือด ลดภาระงานของหัวใจ และปรับปรุงการไหลเวียนเลือด ทำให้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการจัดการภาวะที่หลอดเลือดหดตัวหรือหัวใจได้รับความเครียดสูง นอกจากนี้ ยังแสดงศักยภาพในการแก้ไขภาวะขาดเลือด-กลับคืนการไหลเวียน (ischemia-reperfusion injury) ซึ่งเป็นภาวะแทรกซ้อนที่พบบ่อยหลังหัวใจวายหรือการผ่าตัด โดยช่วยปรับปรุงการทำงานของหัวใจและลดความเสียหายของเนื้อเยื่อ การนำไปใช้ยังอยู่ในการวิจัยสำหรับการรักษาโรคหัวใจและหลอดเลือดในวงกว้าง