อิลโพรสต์ถูกใช้ในการรักษาภาวะความดันโลหิตสูงในปอด (Pulmonary Arterial Hypertension) ซึ่งเป็นภาวะที่ทำให้เส้นเลือดในปอดตีบแคบและความดันโลหิตในปอดเพิ่มขึ้น โดยอิลโพรสต์ช่วยขยายเส้นเลือดในปอด ลดความดันโลหิต และเพิ่มการไหลเวียนของเลือด นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาอาการขาดเลือดที่ปลายมือและเท้า (Raynaud's Phenomenon) ที่เกิดจากภาวะหลอดเลือดหดตัวผิดปกติ โดยช่วยลดความถี่และความรุนแรงของอาการ นอกจากนี้ยังมีการใช้ในผู้ป่วยที่ได้รับการปลูกถ่ายอวัยวะเพื่อป้องกันการเกิดภาวะหลอดเลือดตีบตันหลังการผ่าตัด