Cinaciguat hydrochloride ใช้หลักในการวิจัยทางการแพทย์และพัฒนายา โดยเฉพาะสำหรับการศึกษาโรคหัวใจและหลอดเลือด มันทำหน้าที่เป็นตัวกระตุ้น soluble guanylate cyclase (sGC) ซึ่งช่วยในการควบคุมความดันโลหิตและโทนของหลอดเลือด ทำให้เป็นสารที่มีคุณค่าในการวิจัยการรักษาสำหรับภาวะเช่น หัวใจวายเฉียบพลัน (acute heart failure) และความดันโลหิตสูงในปอด (pulmonary hypertension) นักวิจัยใช้มันเพื่อสำรวจศักยภาพในการปรับปรุงการทำงานของหัวใจและลดอาการที่เกี่ยวข้องกับภาวะเหล่านี้ นอกจากนี้ยังใช้เป็นเครื่องมือในการศึกษาทางเภสัชวิทยาเพื่อเข้าใจกลไกของการกระตุ้น sGC และผลกระทบต่อสุขภาพหลอดเลือดและหัวใจ