ไพริดอกซาล ไฮโดรคลอไรด์ ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีและการประยุกต์ใช้ทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์โคเอนไซม์ต่างๆ และจำเป็นต่อการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์ โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับวิตามินบี6 ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางเมแทบอลิซึมและภาวะทางระบบประสาท เนื่องจากบทบาทในการสังเคราะห์สารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในอาหารเลี้ยงเซลล์เพื่อสนับสนุนการเจริญเติบโตและเมแทบอลิซึมของเซลล์ การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปสู่ผลิตภัณฑ์เสริมอาหารโภชนาการ ซึ่งช่วยรักษาระดับวิตามินบี6 ที่เหมาะสมในร่างกาย