3,6-Dihydroxy-9H-xanthen-9-one ใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยสารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสีย้อมและเม็ดสีต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างตัวบ่งชี้เรืองแสง ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวภาพและเคมีสำหรับการติดตามและการถ่ายภาพ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการพัฒนาสารทำให้สว่างทางแสง ซึ่งช่วยเพิ่มความสวยงามของวัสดุเช่นกระดาษและสิ่งทอโดยการเพิ่มความขาวและความสว่าง คุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ของสารประกอบนี้ยังทำให้เหมาะสำหรับการใช้ในเซ็นเซอร์บางประเภท ซึ่งสามารถช่วยตรวจจับสารเฉพาะหรือการเปลี่ยนแปลงในสภาวะแวดล้อม