สารประกอบนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) สารนี้ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยที่กลุ่ม Fmoc ปกป้องส่วนปลายอะมิโน และกลุ่ม Boc ปกป้องส่วนข้างของออร์นิทีน การป้องกันแบบคู่นี้ช่วยให้สามารถกำจัดกลุ่มป้องกันแบบเลือกสรรได้ในระหว่างการสร้างเปปไทด์แบบขั้นตอน ซึ่งช่วยให้ควบคุมลำดับได้อย่างแม่นยำ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์และโปรตีนที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยในสาขาชีวเคมี ยา และเทคโนโลยีชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาเพปไทด์ สารวินิจฉัย และวัสดุชีวภาพ เนื่องจากความเสถียรและความเข้ากันได้กับโปรโตคอล SPPS มาตรฐาน